منهج العلم هو موضوع مبحث الميثودولوجيا أو منهجية العلم. والميثودولوجيا بدورها، صلب فلسفة العلم وعمودها الفقري. إنها فلسفة النسق العلمي من داخله ومنطق العلاقات بين مكوناته. وفي هذا منهج العلم هو آية العلم والعلم آية منهجه، إنه تعامد العقلانية والتجريبية، حوار الفرض والتجربة، تآزر العقل والحواس، إبداع النظر على محك الواقع